长治医学院创建于1946年,其前身可追溯至晋冀鲁豫军区白求恩国际和平医院总院护士学校。历经数次演变与更名,于1948年改建为白求恩国际和平医科专门学校,随后在1950年7月更名为山西省立长治医科专门学校。1958年,更名为晋东南医学专科学校,并在1986年升格为本科院校。
学校后勤部门自1958年至2000年,其正式名称为长治医学院总务处。进入2000年后,根据长医院办字(2000)第1号、长医党字(2000)第3号、长医党字(2000)第9号、长医政字(2000)第19号及长医后字(2002)第1号等文件精神,学院于2000年9月对原总务处进行了机构调整与改革。
调整后的后勤部门包括:
1. 后勤管理处(甲方),该部门代表学院对后勤部门的工作进行规划、协调、检查与管理。
2. 后勤经济实体(乙方),由学院本部及两个附属医院的后勤服务单位重新整合而成,实行企业化运作,自主经营,独立核算,自负盈亏。其原名为后勤集团公司,后在2002年5月更名为后勤服务集团。
3. 后勤服务集团下设10个科室及产业开发中心等部门。
此架构持续运行至2013年2月,学院决定将后勤管理处与后勤服务集团合并为后勤保障处,并下设5个科室。至2023年12月,该部门正式更名为后勤保障部,并持续至今。